ישנה רשימה ארוכה מאד של חומרים המוגדרים כחומר מסוכן, בניהם דלקים, גזים, חומרי נפץ, חומצות ובסיסים חומרים מחמצנים ממיסים אורגניים ועוד קבוצות רבות של חומרים כימיים אחרים.
חומר מסוכן עלול להשתחרר לאויר, להשפך או אף להתפוצץ ולגרום נזק לאנשים ולרכוש. כאשר מאכסנים חומרים מסוכנים בצורה נכונה ובטוחה אין הם גורמים נזק, אך כאשר הם המאוכסנים בצורה לקויה או משונעים בכבישים הם עלולים להיות מעורבים בתאונה או בשריפה. ארוע כזה מכונה ארוע חומ"ס -חומרים מסוכנים.
האיגוד מטפל בחומרים מסוכנים בשני מישורים:
בעת שיגרה: פיקוח שוטף על מפעלים המחזיקים בחומרים מסוכנים, וטיפול בהוצאת היתרי רעלים.
בעת חרום: טיפול בארועי חומרים מסוכנים ברמה של גילוי, ניטור ויעוץ מקצועי לכוחות ההצלה והחירום. טיפול ארועי חומ"ס עלולים להיות במפעל מסויים או בכבישים שעליהם נוסעים רכבים המובילים חומרים מסוכנים.
בארועי חומ"ס מטפלים כמה גופים:
משטרת ישראל: המשטרה מפקדת על הכוחות בזמן האירוע. תפקידה לסגור את האזור ולטפל באוכלוסיה.
מכבי האש: תפקידם לבצע גילוי וזיהוי ראשוני והערכת סיכונים במקום הארוע, כמו כן הם נכנסים לאזור הארוע כדי לעצור את המשך הארוע וכדי לחלץ נפגעים. לכיבוי אש יש ציוד מגן וניידות מיוחדות לטיפול בחומרים מסוכנים הכוללות ציוד ספיגה איטום וחילוץ.
איכות הסביבה: איגוד ערים לאיכות הסביבה יהודה וניידת החומ"ס של המשרד לאיכות
הסביבה מגיעים למקום האירוע ומבצעים גילוי והערכת סיכונים תוך יעוץ למשטרה ולכיבוי אש כיצד לטפל בחומר המסוכן.
אנשי המפעל: תפקידם לטפל בחומר המסוכן ע"י צוות החירום של המפעל, וכן לייעץ לכיבוי אש ולמשטרה כיצד לטפל בחומר המסוכן.
אנשי הרשות המקומית: תפקידם לסייע באמצעים לטיפול בחומר המסוכן או לסייע בפינוי האוכלוסייה במידה ויש צורך.
פיקוד העורף: במידה והארוע הופך לארוע גדול הצבא תופס פיקוד על האירוע ומגייס כוחות ואמצעים נוספים לטיפול בארוע ובאוכלוסייה.
המשרד להגנת הסביבה בשיתוף עם פיקוד העורף מפעיל "מרכז מידע לחומרים מסוכנים". מרכז המידע מאוייש 24 שעות ביממה והוא מסייע בכל שאלה בנושא חומרים מסוכנים, המרכז מייעץ לכוחות בזמן הארוע כיצד לטפל בחומר המסוכן.
לאיגוד ערים יהודה יש ציוד בסיסי לטיפול בארועי חומ"ס הכולל ציוד גילוי וניטור של חומרים מסוכנים, אמצעי מיגון כגון חליפות מוגנות, ומערכות נשימה הכוללות מסיכות ובלוני אויר. כמו כן ישנם ניידות מיוחדות לטיפול בחומרים מסוכנים של המשרד לאיכות הסביבה המוזעקות לכל ארוע.